Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc172Q810N9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc172Q810N9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc172Q810N9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms