Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcsk9Q80W65 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms