Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sestd1Q80UK0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sestd1Q80UK0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms