Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ube3cQ80U95 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube3cQ80U95 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube3cQ80U95 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms