Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Avl9Q80U56 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Avl9Q80U56 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms