Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ctdp1Q7TSG2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms