Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms