Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf18Q7TS55 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms