Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp397Q7TNK4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Zfp397Q7TNK4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms