Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpf1Q7TND5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpf1Q7TND5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms