Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shq1Q7TMX5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Shq1Q7TMX5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Shq1Q7TMX5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms