Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stambpl1Q76N33 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stambpl1Q76N33 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stambpl1Q76N33 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stambpl1Q76N33 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stambpl1Q76N33 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stambpl1Q76N33 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stambpl1Q76N33 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stambpl1Q76N33 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stambpl1Q76N33 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stambpl1Q76N33 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stambpl1Q76N33 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stambpl1Q76N33 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stambpl1Q76N33 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stambpl1Q76N33 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stambpl1Q76N33 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stambpl1Q76N33 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stambpl1Q76N33 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stambpl1Q76N33 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stambpl1Q76N33 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stambpl1Q76N33 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stambpl1Q76N33 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stambpl1Q76N33 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms