Protein–RNA interactions for Protein: Q71B07

Dpy19l3, Probable C-mannosyltransferase DPY19L3, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpy19l3Q71B07 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dpy19l3Q71B07 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dpy19l3Q71B07 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dpy19l3Q71B07 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dpy19l3Q71B07 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dpy19l3Q71B07 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dpy19l3Q71B07 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dpy19l3Q71B07 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dpy19l3Q71B07 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dpy19l3Q71B07 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dpy19l3Q71B07 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dpy19l3Q71B07 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dpy19l3Q71B07 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dpy19l3Q71B07 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dpy19l3Q71B07 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dpy19l3Q71B07 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Dpy19l3Q71B07 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dpy19l3Q71B07 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dpy19l3Q71B07 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dpy19l3Q71B07 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dpy19l3Q71B07 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dpy19l3Q71B07 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 646.3 ms