Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp34Q6ZQ93 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp34Q6ZQ93 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp34Q6ZQ93 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms