Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chsy1Q6ZQ11 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chsy1Q6ZQ11 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chsy1Q6ZQ11 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Chsy1Q6ZQ11 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chsy1Q6ZQ11 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms