Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ino80Q6ZPV2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ino80Q6ZPV2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ino80Q6ZPV2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ino80Q6ZPV2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ino80Q6ZPV2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms