Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ube2oQ6ZPJ3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ube2oQ6ZPJ3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms