Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms