Protein–RNA interactions for Protein: Q6UGQ3

Scgb2b2, Secretoglobin family 2B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b2Q6UGQ3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scgb2b2Q6UGQ3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scgb2b2Q6UGQ3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scgb2b2Q6UGQ3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scgb2b2Q6UGQ3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scgb2b2Q6UGQ3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scgb2b2Q6UGQ3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scgb2b2Q6UGQ3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scgb2b2Q6UGQ3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scgb2b2Q6UGQ3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scgb2b2Q6UGQ3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scgb2b2Q6UGQ3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scgb2b2Q6UGQ3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scgb2b2Q6UGQ3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scgb2b2Q6UGQ3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Scgb2b2Q6UGQ3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scgb2b2Q6UGQ3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scgb2b2Q6UGQ3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scgb2b2Q6UGQ3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scgb2b2Q6UGQ3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scgb2b2Q6UGQ3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms