Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt9Q6RHW0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt9Q6RHW0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms