Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIC6

Atp1a3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a3Q6PIC6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1a3Q6PIC6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1a3Q6PIC6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms