Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnip4Q6PHZ8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnip4Q6PHZ8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms