Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad54bQ6PFE3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad54bQ6PFE3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad54bQ6PFE3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad54bQ6PFE3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad54bQ6PFE3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rad54bQ6PFE3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rad54bQ6PFE3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad54bQ6PFE3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240.3 ms