Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup98Q6PFD9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup98Q6PFD9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nup98Q6PFD9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms