Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfrlQ6PE55 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfrlQ6PE55 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms