Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCP3

Dusp16, Dual-specificity phosphatase 16, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp16Q6PCP3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dusp16Q6PCP3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dusp16Q6PCP3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms