Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB51

Ccdc117, Coiled-coil domain-containing protein 117, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc117Q6PB51 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc117Q6PB51 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc117Q6PB51 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc117Q6PB51 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms