Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Herc4Q6PAV2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Herc4Q6PAV2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms