Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Gapvd1Q6PAR5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Gapvd1Q6PAR5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Gapvd1Q6PAR5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Gapvd1Q6PAR5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Gapvd1Q6PAR5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Gapvd1Q6PAR5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Gapvd1Q6PAR5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Gapvd1Q6PAR5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Gapvd1Q6PAR5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Gapvd1Q6PAR5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Gapvd1Q6PAR5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Gapvd1Q6PAR5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Gapvd1Q6PAR5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Gapvd1Q6PAR5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Gapvd1Q6PAR5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Gapvd1Q6PAR5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Gapvd1Q6PAR5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Gapvd1Q6PAR5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Gapvd1Q6PAR5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Gapvd1Q6PAR5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Gapvd1Q6PAR5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gapvd1Q6PAR5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gapvd1Q6PAR5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gapvd1Q6PAR5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Gapvd1Q6PAR5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gapvd1Q6PAR5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gapvd1Q6PAR5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gapvd1Q6PAR5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Gapvd1Q6PAR5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Gapvd1Q6PAR5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Gapvd1Q6PAR5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Gapvd1Q6PAR5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Gapvd1Q6PAR5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Gapvd1Q6PAR5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Gapvd1Q6PAR5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Gapvd1Q6PAR5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Gapvd1Q6PAR5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Gapvd1Q6PAR5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Gapvd1Q6PAR5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Gapvd1Q6PAR5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Gapvd1Q6PAR5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Gapvd1Q6PAR5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Gapvd1Q6PAR5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Gapvd1Q6PAR5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms