Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atl2Q6PA06 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atl2Q6PA06 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms