Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6J4

Alkbh2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh2Q6P6J4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alkbh2Q6P6J4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Alkbh2Q6P6J4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Alkbh2Q6P6J4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Alkbh2Q6P6J4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Alkbh2Q6P6J4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Alkbh2Q6P6J4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Alkbh2Q6P6J4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alkbh2Q6P6J4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Alkbh2Q6P6J4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Alkbh2Q6P6J4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alkbh2Q6P6J4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alkbh2Q6P6J4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alkbh2Q6P6J4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alkbh2Q6P6J4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alkbh2Q6P6J4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alkbh2Q6P6J4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alkbh2Q6P6J4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alkbh2Q6P6J4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alkbh2Q6P6J4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms