Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H6

Frmd5, FERM domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd5Q6P5H6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmd5Q6P5H6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd5Q6P5H6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Frmd5Q6P5H6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms