Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sik3Q6P4S6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sik3Q6P4S6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms