Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Slx4Q6P1D7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Slx4Q6P1D7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms