Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrig3Q6P1C6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms