Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc189Q6NZQ0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc189Q6NZQ0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms