Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac4Q6NZM9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms