Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Colgalt2Q6NVG7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms