Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SphkapQ6NSW3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SphkapQ6NSW3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SphkapQ6NSW3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms