Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep78Q6IRU7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms