Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CltbQ6IRU5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms