Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpm4Q6IRU2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm4Q6IRU2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpm4Q6IRU2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms