Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt40Q6IFX3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
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