Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg9bQ6EBV9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atg9bQ6EBV9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms