Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cep290Q6A078 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep290Q6A078 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
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