Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cep170Q6A065 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cep170Q6A065 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cep170Q6A065 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cep170Q6A065 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cep170Q6A065 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cep170Q6A065 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cep170Q6A065 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cep170Q6A065 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cep170Q6A065 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cep170Q6A065 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cep170Q6A065 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Cep170Q6A065 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cep170Q6A065 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cep170Q6A065 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cep170Q6A065 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cep170Q6A065 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cep170Q6A065 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cep170Q6A065 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cep170Q6A065 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Cep170Q6A065 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Cep170Q6A065 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Cep170Q6A065 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cep170Q6A065 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Cep170Q6A065 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
Cep170Q6A065 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Cep170Q6A065 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Cep170Q6A065 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cep170Q6A065 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cep170Q6A065 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cep170Q6A065 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cep170Q6A065 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cep170Q6A065 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cep170Q6A065 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cep170Q6A065 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Cep170Q6A065 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cep170Q6A065 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cep170Q6A065 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cep170Q6A065 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cep170Q6A065 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cep170Q6A065 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cep170Q6A065 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cep170Q6A065 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Cep170Q6A065 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cep170Q6A065 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Cep170Q6A065 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cep170Q6A065 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cep170Q6A065 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cep170Q6A065 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms