Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tmcc1Q69ZZ6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmcc1Q69ZZ6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms