Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zcchc2Q69ZB8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms