Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spty2d1Q68FG3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spty2d1Q68FG3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms