Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VclQ64727 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VclQ64727 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VclQ64727 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VclQ64727 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VclQ64727 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VclQ64727 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VclQ64727 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VclQ64727 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VclQ64727 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VclQ64727 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VclQ64727 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VclQ64727 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VclQ64727 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VclQ64727 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VclQ64727 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VclQ64727 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VclQ64727 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VclQ64727 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VclQ64727 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VclQ64727 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VclQ64727 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VclQ64727 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VclQ64727 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VclQ64727 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VclQ64727 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VclQ64727 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VclQ64727 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VclQ64727 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VclQ64727 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VclQ64727 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VclQ64727 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VclQ64727 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VclQ64727 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VclQ64727 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VclQ64727 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VclQ64727 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VclQ64727 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VclQ64727 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VclQ64727 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VclQ64727 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VclQ64727 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VclQ64727 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VclQ64727 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VclQ64727 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VclQ64727 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VclQ64727 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VclQ64727 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VclQ64727 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VclQ64727 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VclQ64727 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VclQ64727 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VclQ64727 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VclQ64727 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VclQ64727 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VclQ64727 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VclQ64727 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VclQ64727 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VclQ64727 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VclQ64727 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VclQ64727 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VclQ64727 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VclQ64727 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VclQ64727 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VclQ64727 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VclQ64727 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VclQ64727 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VclQ64727 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VclQ64727 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VclQ64727 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VclQ64727 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VclQ64727 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VclQ64727 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VclQ64727 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VclQ64727 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VclQ64727 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VclQ64727 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VclQ64727 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VclQ64727 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VclQ64727 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VclQ64727 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
VclQ64727 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VclQ64727 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VclQ64727 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VclQ64727 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VclQ64727 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VclQ64727 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VclQ64727 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VclQ64727 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VclQ64727 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VclQ64727 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VclQ64727 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VclQ64727 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VclQ64727 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VclQ64727 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VclQ64727 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VclQ64727 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VclQ64727 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VclQ64727 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VclQ64727 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms